Creating New Experiments
Die CytExpert-Software trennt Farbkompensations- und Probenerfassungsexperimente in separate Dateien mit den Endungen .xitc bzw. .xit. Der Versuchsbediener kann wählen, welches zuerst ausgeführt werden soll.
Neues Experiment anlegen (.xit)
- Wählen Sie New Experiment (Neues Experiment) im Menü File (Datei), geben Sie den Dateipfad an und benennen Sie das Experiment oder akzeptieren Sie die Standardbenennung Exp_YYYYMMDD-1 und wählen Sie Save (Speichern).
- Wählen Sie Set Channel (Kanal festlegen) aus dem Menü Settings (Einstellungen) aus. Wählen Sie die gewünschten Kanalsignale im Kontrollkästchen aus. Geben Sie, falls gewünscht, den Reagensnamen in die Etikettenspalte ein.
- Erkunden Sie die Schaltflächen auf der Symbolleiste, um Darstellungen im Arbeitsbereich des Experiments zu erstellen. Einen Achsennamen auswählen, um zu ändern, welcher Kanal angezeigt wird.
- Zur Erstellung von Gates die Steuerungsschaltflächen verwenden oder den Plot mit der rechten Maustaste anklicken und den gewünschten Gate-Typ auswählen.
- Wählen Sie den Überschriftenbereich des Plots, um die Tore den gewünschten Plots zuzuweisen.
- Wählen Sie in der Symbolleiste die Schaltfläche Bevölkerungshierarchie , um die Bevölkerungshierarchie anzuzeigen. Sie können die Farbe und die Namen der Gatter ändern, indem Sie im Fenster der Bevölkerungshierarchie auf die Farbe oder den Namen doppelklicken.
- Wählen Sie die Schaltfläche Statistik für die Symbolleiste, um das Statistikfenster anzuzeigen. Klicken Sie mit der rechten Maustaste auf die Tabelle Statistics und wählen Sie Statistics Setting und überprüfen Sie die gewünschte Kopfzeile, Statistiken und Populationen von Interesse.
- Wählen Sie die Akq. Schaltfläche Einstellung auf der linken Seite zum Öffnen der Schaltfläche Acq. Einstellung Fenster und Anzeige der Zytometerverstärkungen und Schwellenwerteinstellungen. Wählen Sie auf der Registerkarte Verstärkung die Option Empfohlen in Fällen, in denen Sie keine eigenen Standardparameter-Verstärkungseinstellungen festlegen.
- Importieren Sie eine Kompensationsmatrix, um bei Bedarf Kompensationswerte zum Experimentieren anzuwenden, indem Sie Kompensationsmatrix aus dem Menü Einstellungen auswählen, um die Tabelle der Kompensationsmatrix aufzurufen. Wählen Sie Aus Bibliothek importieren oder Importieren und suchen Sie die zu importierende Kompensationsmatrixdatei (.comp). Wählen Sie die gewünschte Option zum Importieren von Kompensationsmatrix- und Verstärkungseinstellungen. Weitere Informationen finden Sie unter Importieren und Exportieren von Kompensation im Kompensationsmodul der Cytoflex IFU.
Erfassen und Sammeln von Daten
- Platzieren Sie das Probenröhrchen in den Probenröhrchenhalter und wählen Sie Run, um die Probe zu laden. Wählen Sie im Acquisition -Panel die Probenflussrate und geben Sie die gewünschten Erfassungseinstellungen für anzuzeigende Ereignisse, aufzuzeichnende Ereignisse und aufzuzeichnende Zeit ein.
- Passen Sie die Verstärkungseinstellungen für die verschiedenen Kanäle im Register Verstärkung im Register Acq.an. Einstellung Fenster oder verwenden Sie die Schaltfläche Verstärkungssteuerung auf der Symbolleiste direkt auf dem Diagramm, auf dem die Daten während der Datenerfassung erscheinen. Ein Erhöhen der Verstärkung verstärkt das Signal. Ein Verringern der Verstärkung schwächt das Signal.
Hinweis:Verstärkungseinstellungen gemäß angestrebten Experimentzielen optimieren. Die empfohlenen Werte dienen lediglich zur Orientierung. - Passen Sie die Schwellwerteinstellungen bei Bedarf an, um unnötiges Signalrauschen zu entfernen, indem Sie die Registerkarte Schwellwert in der Registerkarte Acq. auswählen. Setting (Erfassungseinstellung) auswählen. Wählen Sie den Kanal für die Schwellenwerteinstellung und geben Sie manuell einen Wert im Register Schwellenwert ein. Alternativ wählen Sie die Schaltfläche Threshold in der Symbolleiste und bewegen Sie die Maus an die gewünschte Schwellenposition in der gewünschten Darstellung.
- Wählen Sie Datensatz um die Daten zu speichern und auf das Ende des Speichervorgangs zu warten. Die Probenröhrchenhalterung kehrt in die Probenladeposition zurück. Fügen Sie bei Bedarf zusätzliche Röhren zur Liste Tube hinzu, laden Sie Röhren und zeichnen Sie Daten für jede Röhre auf, bis alle erforderlichen Daten erfasst wurden.
Identifizieren Sie Statistiken, die mit dem Experiment exportiert werden
Die Statistiktabelle kann durch Auswahl des Symbols 'Statistik' auf der Registerkarte 'Arbeitsbereich' erstellt werden.
- Sobald sich die Statistiktabelle öffnet, klicken Sie mit der rechten Maustaste auf die Tabelle, um das Menü aufzurufen.
- Wählen Sie Statistik-Einstellungen und wählen Sie hier die Statistik, die Bevölkerung und die Kopfzeile, die Sie anzeigen möchten.
- Wählen Sie Auf alle Röhren anwenden am unteren Rand des Fensters Statistische Einstellung wenn Sie auf alle Proben anwenden möchten. Wählen Sie OK sobald Sie fertig sind.
- Wenn Sie die Statistiken in eine csv-Tabelle exportieren möchten, klicken Sie mit der rechten Maustaste auf die Tabelle und wählen Sie Alle Stichproben in CSV-Datei exportieren. Wählen Sie das Verzeichnis und speichern Sie die Datei.
- Sie können diese Datei in Excel öffnen und außerdem als .xls-Datei speichern.
Datenanalyse
- Vorhandenes Experiment öffnen:
Menü Datei > FCS-Datei auswählen, öffnen. Importierte Dateien haben jetzt einen grünen Kreis. - Wählen Sie das Analysesymbol auf der linken Seite des Bildschirms
- Verwenden Sie nach Bedarf Plotting-Tools, um die Analyse abzuschließen. Mehrfachdaten- oder Überlagerungsdiagramme (Pulldown-Menü). Wählen Sie das Diamantwerkzeug zum Füllen von Überlagerungen oder ziehen Sie Dateien per Drag & Drop.
Ausführlichere Anweisungen zur Verwendung finden Sie im Benutzerhandbuch zur Datenanalyse.